Veiksmingus vaistus nuo prostatito skiria gydytojas, atsižvelgdamas į simptomų sunkumą, patologijos laipsnį ir tyrimų rezultatus. Antibakterinės medžiagos, anestetikai, alfa adrenoblokatoriai, raumenų relaksantai, angioprotektoriai, vaistažolių preparatai ir vitaminai nuo prostatito.